Yeni hazırlanacak anayasada orduya dokunulmazlık verilmesini de isteyen Savunma Bakanı Sisi, şu ifadeleri kullanıyor:
"Ordunun ülke yönetiminde büyük bir rolü var. Yeni dönemde de bu rol 5-10 yıl daha devam edecektir. Devleti yönetecek olan kim olursa olsun, ister laik, ister liberal isterse dini eğilimleri olan biri olsun, ordunun eli devletin üzerinde olacaktır. Orduda kararlar büyük bir titizlikle alınır. Bu nedenle Mısır'ın içinde bulunduğu bu gevşeklik halinde kararlarının tek bir kişinin eline bırakılması doğru olmaz. Yeni hazırlanacak anayasada orduya anayasal dokunulmazlık verilmesi gerekir."
Sisi, askeri darbeyle görevinden alınan ülkenin seçimle işbaşına gelmiş ilk Cumhurbaşkanı Muhammed Mursi'nin 12 Ağustos 2012'de Yüksek Askeri Konsey yetkililerinden Savunma Bakanı Mareşal Hüseyin Tantavi ile yardımcısı General Sami Anan'ı görevden almasıyla ilgili de "O dönem başta olanlar ordunun bu karara nasıl ve ne kadar büyük bir tepki vereceğini bilemediler. Onlar ordunun gücünün farkında olsalardı bu kararı almazlardı" ifadelerini kullanıyor.