SEZON sonunda Beşiktaş'tan ayrılması beklenen Fernandes'in sakatlığı geçmesine rağmen idmanlara çıkmadığı iddia edildi. Beşiktaş Yönetimi'nin yeni sezonda kadroda düşünmediği Manuel Fernandes'i gözden çıkardığı için iyileşme sürecini ağırdan almasına ses çıkarmayıp göz yumduğu gelen iddialar arasında.