Yelena Gaziyeviç Isinbayeva 3 Haziran 1982'de Rusya'nın Volgograd şehrinde doğdu. Dağıstanlı olan babası tesisatçı, Rus olan annesi ise şehrin ısıtma merkezinde işçiydi. Ailesi kızlarının spora yatkın olduğunu fark edip 4 yaşında jimnastik okuluna yolladılar. Buradaki katı eğitime daha fazla dayanamayıp 15 yaşında okuldan ayrıldı. Antrenörü Alexander Isova, sporu bırakmaması için çok uğraştı. 1,74 olan boyunun uzun olması nedeniyle onu sırıkla atlamaya yönlendirdi. Altı aylık bir eğitim sonrası Moskova'da yapılan Dünya Gençlik Oyunları'nda 4 metrelik atlayışıyla ilk birinciliğini kazandı. Bir yıl sonra yani 1999'da Polonya'da düzenlenen Dünya Gençler Şampiyonası'nda 4,10'luk derecesiyle ilk uluslararası şampiyonluğunu kazandı.