İstanbul başta olmak üzere çok sayıda ilde düzenlenen "Paralel Yapı"ya yönelik operasyon kapsamında gözaltına alınan ve aralarında İstanbul eski Emniyet Müdür Yardımcısı Mahir Çakallı ile Organize Suçlarla Mücadele eski Şube Müdürü Nazmi Ardıç'ın da bulunduğu 29 şüpheli, "darbeye teşebbüs" ile "siyasal ve askeri casusluk" suçlarından tutuklanma istemiyle mahkemeye sevk edildi. Söz konusu soruşturmada, polislerin casusluk suçu kapsamına giren yöntemlerle İstanbul İstihbarat Şube'yi Temmuz 2013'ten itibaren 5 ay süreyle dinlediği, dinlemelerin özellikle 17-25 Aralık sürecinde yoğunlaştığı belirlendi.
Şubede bulunan bilgisayarlardaki verilerin daha sonra silindiği, en çok silmenin ise 23-24-25 Aralık tarihlerinde yapıldığı görüldü.